La historia de este centro se inicia durante la primera mitad de la década de los 70 a través de luchas y manifestaciones populares de grupos comunitarios que veían necesaria la construcción de un centro en cada localidad de los barrios de la zona norte del Distrito Nacional que reuniera las características adecuadas para la docencia ya que en esa época existían 19 escuelas improvisadas que funcionaban en locales sin condiciones para efectuar la labor docente. En esta lucha participaban los tradicionales grupos vinculados a la izquierda como el FEFLAS, FELABEL, los CLP (comités de lucha popular), la ADP entre otros.
Luego de muchos años de luchas, esfuerzos, sacrificios y muertes donde cabe destacar los nombres de Domingo Mejía, Danilo de la Cruz, Abel Rojas, Geraldo Santana, entre otros; se firma un primer intento a través de un convenio con el gobierno constitucional del periodo 1996-2000, lo cual no fue realizado.
En el año 2002 se logra la construcción de varios centros educativos entre los que está el centro educativo capotillo como resultado de la firma de un acuerdo entre los grupos sociales y religiosos con el gobierno del periodo constitucional 2000-2004,en el llamado pacto social de capotillo; por el gobierno firmaron la Dra. Milagros Ortiz Bosch secretaria de educación, Sergio Grullón, y otros funcionarios del gobierno de turno, por la comunidad el profesor y dirigente comunitario Danilo de la cruz, el comunitario Abel Rojas, el párroco Fermín Fermín, entre otros representantes de organizaciones, iglesias, ONG, etc.
En esta primera etapa solo se construye un modulo, en el cual funcionaba el proyecto escuela nuevo colegio dirigido por el Lic. Marcelino Álvarez y la Lic. Bertha Sosa aclarando que el centro fue construido en el terreno donde funcionaba el Centro Educativo Nuevo Colegio el cual fue cedido por el director antes mencionado y los maestros trabajaron sin estar nombrados en un local alquilado por el Ministerio de Educación durante dos períodos escolares a fin de lograr la escuela.
La segunda etapa se inauguró en el año 2007 gobierno constitucional de 2004-2008. En este proceso se fusionaron las escuelas Gregorio Luperón encabezada por la directora Prof. María Francisca Cruz y la Escuela Básica Capotillo dirigida por la Lic. Godiva Chevalier y la Lic. Eduardina Feliz.
La segunda etapa se inauguró en el año 2007 gobierno constitucional de 2004-2008. En este proceso se fusionaron las escuelas Gregorio Luperón encabezada por la directora Prof. María Francisca Cruz y la Escuela Básica Capotillo dirigida por la Lic. Godiva Chevalier y la Lic. Eduardina Feliz.
